按成像方式不同，可分為對原位根系圖像的分析儀，以及對洗根後的根系圖像分析儀。一般都要求可分析根系的長度、直徑、面積、體積、根尖數、分叉數、根交叉數等。專業些的根系分析系統，還可分析植物根系的主側根拓撲形態關係、連接關係，以及根尖部位的色彩變化，以便進行根系形態和構造研究。最新的根系分析系統應具備大批量圖像的全自動分析特性，用戶可對自動分析結果進行局部的交互編輯修正，以確保資料的科學性。

對原位根系圖像，因根系與土壤的顏色可能非常接近，故採用圖像中根系目標的自動增強後，以交互引導的方式進行標記分析的。

另外，還有引入分形維數，以及長條圖投影來進行根系整體生物量分析的。根系分析的最新技術還可分析根瘤菌體積在根系中的占比，以客觀確定根瘤菌體的貢獻量。

特點：
 人工輔助修正：圖像可放大縮小和局部觀察。
 統計效果監視：監視和修正植物物件分析的精度。
 自動雜質剔除：根據尺寸等方面的區別，進行自動雜質剔除。
 輔助測量功能：
    尺寸標定：自帶標定功能，實現半自動的尺寸標定，XY向可分別標定修正。
    長度測量：具有跟隨放大鏡功能，通過滑鼠拖動精確測量。
    數據匯出：分析圖像、分佈圖、結果資料可保存，分析結果輸出至Excel表，可輸出分析標記圖。

規格：
1. 根總長；
2. 根平均直徑；
3. 根總面積；
4. 根總體積；
5. 根尖計數；
6. 分叉數；
7. 交叉數；
8. 根直徑等級；
9. 可不等間距地自訂分段直徑，自動測量各直徑段長度、投影面積、表面積、
    體積等，及其分佈參數；
10. 根尖段長分佈；
11. 能進行根系的顏色分析，確定出根系存活數量，輸出不同顏色根系的直徑、
     長度、投影面積、表面積、體積；
12. 能進行根系的分析，自動確定根的連接數、關係角等，可單獨自動分析主根
      或任意一支側根的長度和分叉數等；
13. 可單獨顯示標記根系的任意直徑段相應各參數（分檔數、檔直徑範圍任意可改）；
14. 能進行根的分叉裁剪、合併、連接等修正，修正操作能回退，以快速獲得100%正確的結果。
     精度：根長≤±1%；面積：優質圖像品質時<1%，標準圖像品質時≤3%；
15. 可兼做針葉面積、體積測量，以及棉纖維粗細、長度測量。