按成像方式不同，可分为对原位根系图像的分析仪，以及对洗根后的根系图像分析仪。一般都要求可分析根系的长度、直径、面积、体积、根尖数、分叉数、根交叉数等。专业些的根系分析系统，还可分析植物根系的主侧根拓扑形态关系、连接关系，以及根尖部位的色彩变化，以便进行根系形态和构造研究。最新的根系分析系统应具备大批量图像的全自动分析特性，用户可对自动分析结果进行局部的交互编辑修正，以确保资料的科学性。

对原位根系图像，因根系与土壤的颜色可能非常接近，故采用图像中根系目标的自动增强后，以交互引导的方式进行标记分析的。

另外，还有引入分形维数，以及长条图投影来进行根系整体生物量分析的。根系分析的最新技术还可分析根瘤菌体积在根系中的占比，以客观确定根瘤菌体的贡献量。

特点：
 人工辅助修正：图像可放大缩小和局部观察。
 统计效果监视：监视和修正植物物件分析的精度。
 自动杂质剔除：根据尺寸等方面的区别，进行自动杂质剔除。
 辅助测量功能：
    尺寸标定：自带标定功能，实现半自动的尺寸标定，XY向可分别标定修正。
    长度测量：具有跟随放大镜功能，通过滑鼠拖动精确测量。
    数据汇出：分析图像、分布图、结果资料可保存，分析结果输出至Excel表，可输出分析标记图。

规格：
1. 根总长；
2. 根平均直径；
3. 根总面积；
4. 根总体积；
5. 根尖计数；
6. 分叉数；
7. 交叉数；
8. 根直径等级；
9. 可不等间距地自订分段直径，自动测量各直径段长度、投影面积、表面积、
    体积等，及其分布参数；
10. 根尖段长分布；
11. 能进行根系的颜色分析，确定出根系存活数量，输出不同颜色根系的直径、
     长度、投影面积、表面积、体积；
12. 能进行根系的分析，自动确定根的连接数、关系角等，可单独自动分析主根
      或任意一支侧根的长度和分叉数等；
13. 可单独显示标记根系的任意直径段相应各参数（分档数、档直径范围任意可改）；
14. 能进行根的分叉裁剪、合并、连接等修正，修正操作能回退，以快速获得100%正确的结果。
     精度：根长≤±1%；面积：优质图像品质时<1%，标准图像品质时≤3%；
15. 可兼做针叶面积、体积测量，以及棉纤维粗细、长度测量。